El conjunto del Convento consta de varios cuerpos de edificación, articulados por varios patios. Uno de ellos, el principal, tiene un claustro de características mudéjares; los restantes responden a los caracteres propios de la arquitectura tradicional andaluza. Fray Andrés de Guadalupe explica en su libro el motivo que llevó a Juan Manosalbas a fundar el Convento de Santa Clara. Al parecer, mató a puñaladas a su mujer cuando creyó que ésta le había sido infiel. Luego resultó que tales sospechas eran infundadas y, arrepentido, quiso reparar la memoria de su esposa y expiar sus culpas. Esta teoría ha sido recogida luego por otros autores hasta el punto de estar bastante extendida por Palma del Río.
